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Planilla en El Salvador: Cómo calcular ISSS, AFP e ISR correctamente

Calcular la planilla en El Salvador es uno de los procesos que más errores genera en las empresas. Un descuento mal aplicado de ISSS o AFP puede resultar en multas del Ministerio de Trabajo o inconsistencias en la declaración del ISR. En este artículo te explicamos cómo funciona cada descuento y cómo automatizar el proceso completo.

Los tres descuentos obligatorios

Toda planilla mensual en El Salvador debe aplicar tres retenciones legales sobre el salario de cada empleado:

1. ISSS (Seguro Social)

El Instituto Salvadoreño del Seguro Social se financia con aportaciones tanto del empleado como del patrono:

PorcentajeTope mensual
Cuota laboral3.0%Salario tope ISSS
Cuota patronal7.5%Salario tope ISSS

El salario tope para el cálculo del ISSS lo actualiza periódicamente el instituto. Es importante verificar la tabla vigente antes de cerrar cada planilla.

2. AFP (Pensiones)

El sistema de pensiones privado aplica descuentos sobre el salario devengado sin tope:

Porcentaje
Cuota laboral7.25%
Cuota patronal7.75%

El empleado puede estar afiliado a CRECER o a Confía — el sistema debe registrar correctamente el fondo de cada trabajador para el cálculo y el archivo de remesa.

3. ISR (Impuesto sobre la Renta)

El ISR se calcula con una tabla de tramos progresivos. El sueldo mensual del empleado determina en qué tramo cae y cuánto se retiene:

  • Hasta $487/mes: exento
  • $487.01 – $915/mes: 10% sobre el exceso de $487
  • $915.01 – $2,157/mes: $42.79 + 20% sobre el exceso de $915
  • Más de $2,157/mes: $291.19 + 30% sobre el exceso de $2,157

Estos rangos corresponden a la tabla vigente en 2025. Verifica siempre la resolución más reciente del Ministerio de Hacienda.

Horas extras y nocturnidad

El Código de Trabajo establece recargos específicos que deben reflejarse en la planilla:

  • Hora extra diurna: 100% adicional sobre la hora normal
  • Hora extra nocturna: 150% adicional
  • Trabajo en día de descanso: 100% adicional más el descanso compensatorio

Para calcular correctamente estos factores es necesario configurarlos en el sistema una sola vez. En AzteQ puedes definir los factores de horas extras y nocturnidad por empleado o por grupo.

Planilla única: qué es y cuándo usarla

La planilla única consolida todos los empleados activos en un solo proceso de cálculo. Es el flujo estándar para empresas que pagan a todos sus colaboradores en el mismo período. En AzteQ, generar la planilla única toma unos pocos clics: el sistema toma los salarios base, aplica movimientos de nómina (ausencias, bonos, horas extras registradas) y calcula automáticamente todos los descuentos.

Movimientos de nómina: incidencias antes del cierre

Antes de cerrar la planilla debes registrar todas las incidencias del período:

  • Horas extras trabajadas
  • Ausencias justificadas o no
  • Bonos o comisiones
  • Préstamos a empleados
  • Descuentos adicionales

En AzteQ puedes registrar movimientos por nómina completa (aplica a todos los empleados del grupo) o por empleado individual, lo que es útil para bonos o descuentos puntuales.

Errores comunes en la planilla

Los más frecuentes que encontramos en las empresas que llegan a AzteQ:

  1. Aplicar la cuota ISSS sobre salarios que superan el tope — se descuenta de más al empleado
  2. No actualizar la tabla ISR — retenciones incorrectas que el empleado debe pagar al año siguiente
  3. Olvidar registrar el AFP del empleado correcto — remesas enviadas a fondo incorrecto
  4. Calcular horas extras sin aplicar el factor correcto — subpago que puede derivar en demandas

Automatizar el cálculo elimina prácticamente todos estos errores porque las tablas y factores están configurados una sola vez en el sistema.

Archivos bancarios y boletas de pago

Una vez cerrada la planilla, AzteQ genera:

  • Archivo de transferencias en el formato específico de cada banco (Agrícola, Davivienda, BAC, etc.) para pago masivo a empleados
  • Boletas de pago individuales en PDF con detalle de devengados y descuentos
  • Remesas de ISSS y AFP listas para presentar ante cada institución

¿Tienes dudas sobre la configuración de tu planilla? Escríbenos por WhatsApp o a soporte@azteq.software.